korean:mecab:khcoder

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--- korean:mecab:khcoder [2015/12/28 13:07] – yoshi
+++ korean:mecab:khcoder [2016/09/01 22:32] – [ヒートマップ作成に必要なパッケージ] yoshi
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 ==== 共起ネットワークに必要なパッケージ ====
-Rの方でigraph 1.0.1をインストールしていたのですが，描画に失敗しました．[[https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/igraph/|CRANのigraphアーカイブ]]からバージョンの''0.5.4-4''をダウンロードして，''~/Desktop''に解凍した場合，
+Rの方で''igraph''パッケージの''1.0.1''をインストールしていたのですが，描画に失敗しました．[[https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/igraph/|CRANのigraphアーカイブ]]からバージョンの''0.5.4-4''をダウンロードして，''~/Desktop''に解凍した場合，
 <code r>
@@ 行 158: / 行 158: @@
 </code>
-でインストールします．[[http://koichi.nihon.to/cgi-bin/bbs_khn/khcf.cgi?no=1151&reno=1149&oya=1135&mode=msgview|KH Coderの掲示板]]を参考にしました．
+でインストールします．[[http://koichi.nihon.to/cgi-bin/bbs_khn/khcf.cgi?no=1151&reno=1149&oya=1135&mode=msgview|KH Coderの掲示板]]を参考にしました．バージョンの''0.6''以上だと，パッケージインストールの際に''gfortran-4.2''が無いと言われてインストール出来ませんでした．
 ==== 対応分析に必要なパッケージ ====
@@ 行 166: / 行 166: @@
 ==== 階層的クラスター分析に必要なパッケージ ====
-Rで，''ggdendro''パッケージをインストールします．
+Rで，''ggdendro''と''amap''パッケージをインストールします．
+==== ヒートマップ作成に必要なパッケージ ====
+Rで''pheatmap''をインストールしますが，[[https://cran.r-project.org/web/packages/pheatmap/index.html|CRANのパッケージサイト]]からArchiveへ進み，バージョン''0.7.7''をダウンロードして，インストールします．
+<code r>
+install.packages("pheatmap_0.7.7.tar.gz", repos=NULL, type="source")
+</code>
+Rから直接最新版をインストールすると，描画に失敗します．
 ====== 参考文献・リンク ======

korean/mecab/khcoder.txt · 最終更新: 2018/02/28 15:37 by yoshi