korean:mecab:khcoder

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--- korean:mecab:khcoder [2015/12/28 22:35] – [階層的クラスター分析に必要なパッケージ] yoshi
+++ korean:mecab:khcoder [2018/02/28 15:37] (現在) – [共起ネットワークに必要なパッケージ] yoshi
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 でインストールします．[[http://koichi.nihon.to/cgi-bin/bbs_khn/khcf.cgi?no=1151&reno=1149&oya=1135&mode=msgview|KH Coderの掲示板]]を参考にしました．バージョンの''0.6''以上だと，パッケージインストールの際に''gfortran-4.2''が無いと言われてインストール出来ませんでした．
+=== 新しいバージョンでエラーが出る場合 ===
+igraph 1.1.2，ggplot 2.2.1で共起ネットワークを作成する際，
+<code>
+Error: StatEdges was built with an incompatible version of ggproto. Please reinstall the package that provides this extension.
+</code>
+というエラーが出る場合には，''ggnetwork''をソースからインストールします．
+<code r>
+install.packages("ggnetwork", type="source")
+</code>
 ==== 対応分析に必要なパッケージ ====
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 ==== 階層的クラスター分析に必要なパッケージ ====
-Rで，''ggdendro''パッケージと''amap''パッケージをインストールします．
+Rで，''ggdendro''と''amap''パッケージをインストールします．
+==== ヒートマップ作成に必要なパッケージ ====
+Rで''pheatmap''をインストールしますが，[[https://cran.r-project.org/web/packages/pheatmap/index.html|CRANのパッケージサイト]]からArchiveへ進み，バージョン''0.7.7''をダウンロードして，インストールします．
+<code r>
+install.packages("pheatmap_0.7.7.tar.gz", repos=NULL, type="source")
+</code>
+Rから直接最新版をインストールすると，描画に失敗します．
 ====== 参考文献・リンク ======

korean/mecab/khcoder.1451309754.txt.gz · 最終更新: 2015/12/28 22:35 by yoshi