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korean:mecab:khcoder

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korean:mecab:khcoder [2015/12/28 13:10] – [共起ネットワークに必要なパッケージ] yoshikorean:mecab:khcoder [2018/02/28 15:37] (現在) – [共起ネットワークに必要なパッケージ] yoshi
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 でインストールします.[[http://koichi.nihon.to/cgi-bin/bbs_khn/khcf.cgi?no=1151&reno=1149&oya=1135&mode=msgview|KH Coderの掲示板]]を参考にしました.バージョンの''0.6''以上だと,パッケージインストールの際に''gfortran-4.2''が無いと言われてインストール出来ませんでした. でインストールします.[[http://koichi.nihon.to/cgi-bin/bbs_khn/khcf.cgi?no=1151&reno=1149&oya=1135&mode=msgview|KH Coderの掲示板]]を参考にしました.バージョンの''0.6''以上だと,パッケージインストールの際に''gfortran-4.2''が無いと言われてインストール出来ませんでした.
 +
 +=== 新しいバージョンでエラーが出る場合 ===
 +
 +igraph 1.1.2,ggplot 2.2.1で共起ネットワークを作成する際,
 +
 +<code>
 +Error: StatEdges was built with an incompatible version of ggproto. Please reinstall the package that provides this extension.
 +</code>
 +
 +というエラーが出る場合には,''ggnetwork''をソースからインストールします.
 +
 +<code r>
 +install.packages("ggnetwork", type="source")
 +</code>
  
 ==== 対応分析に必要なパッケージ ==== ==== 対応分析に必要なパッケージ ====
行 166: 行 180:
 ==== 階層的クラスター分析に必要なパッケージ ==== ==== 階層的クラスター分析に必要なパッケージ ====
  
-Rで,''ggdendro''パッケージをインストールします.+Rで,''ggdendro''と''amap''パッケージをインストールします. 
 + 
 +==== ヒートマップ作成に必要なパッケージ ==== 
 + 
 +Rで''pheatmap''をインストールしますが,[[https://cran.r-project.org/web/packages/pheatmap/index.html|CRANのパッケージサイト]]からArchiveへ進み,バージョン''0.7.7''をダウンロードして,インストールします. 
 + 
 +<code r> 
 +install.packages("pheatmap_0.7.7.tar.gz", repos=NULL, type="source"
 +</code> 
 + 
 +Rから直接最新版をインストールすると,描画に失敗します.
  
 ====== 参考文献・リンク ====== ====== 参考文献・リンク ======
korean/mecab/khcoder.1451275818.txt.gz · 最終更新: 2015/12/28 13:10 by yoshi